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微生物所等在藥用真菌二萜環(huán)化酶研究中取得進(jìn)展

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微生物所等在藥用真菌二萜環(huán)化酶研究中取得進(jìn)展

摘要:   二萜化合物是一類廣泛分布在植物、真菌、細(xì)菌和海洋生物中的天然化合物,結(jié)構(gòu)豐富多樣并且多具有很好的生物活性,包括臨床上用于治療癌癥的藥物紫杉醇(Taxol);治療心血管系統(tǒng)疾病的銀杏內(nèi)酯、丹參酮(Tanshin ...

  二萜化合物是一類廣泛分布在植物、真菌、細(xì)菌和海洋生物中的天然化合物,結(jié)構(gòu)豐富多樣并且多具有很好的生物活性,包括臨床上用于治療癌癥的藥物紫杉醇(Taxol);治療心血管系統(tǒng)疾病的銀杏內(nèi)酯、丹參酮(Tanshinone)以及抗炎止痛的pseudopterosin A等。由于二萜化合物重要的醫(yī)用價值,負(fù)責(zé)其生物合成的二萜環(huán)化酶的學(xué)習(xí)近年來引起了極大的關(guān)注。
  鳥巢烷二萜是一類主要由擔(dān)子菌(Cyathus, Hericium, Sarcodon, etc.)產(chǎn)生的天然產(chǎn)物,具有罕見的特征性的5/6/7三環(huán)骨架和多樣的生物活性,包括抗菌、抗腫瘤、促進(jìn)神經(jīng)生長因子生長等。其中的erinacine A對老年癡呆的模型小鼠具有治療作用,有望開發(fā)成為治療老年癡呆的藥物。該類化合物化學(xué)全合成路線復(fù)雜,難以應(yīng)用。合成生物學(xué)的發(fā)展為鳥巢烷二萜的大規(guī)模制備提供了可能性,但迄今為止負(fù)責(zé)該類化合物生物合成的基因和酶仍然不清楚。
  中國科學(xué)院微生物學(xué)習(xí)所劉宏偉學(xué)習(xí)組從猴頭菇、鳥巢菌屬真菌中發(fā)現(xiàn)了20個具有抗腫瘤活性的鳥巢烷二萜新化合物(Fitoterapia, 2013, 76, 45; Food Chem., 2014, 152, 169; J. Biol. Chem., 2015, 290, 23563;Eur. J. Med. Chem., 2016, 111, 183)。為便于開展鳥巢烷二萜的生物合成機制學(xué)習(xí),該學(xué)習(xí)組與中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物學(xué)習(xí)所學(xué)習(xí)員郭順星團(tuán)隊合作首次測定了猴頭菇的全基因組。在此基礎(chǔ)上,通過生物信息學(xué)、代謝產(chǎn)物譜以及定量PCR技術(shù)在猴頭菇(Hericium erinaceum)和隆紋黑蛋巢(Cyathus striatus)中確定了負(fù)責(zé)鳥巢烷二萜生物合成的基因簇;通過全基因合成、異源表達(dá)及酶催化活性學(xué)習(xí)首次鑒定了鳥巢烷二萜環(huán)化酶EriG;以鳥巢烷二萜環(huán)化酶EriG基因序列為參考,通過基因組大數(shù)據(jù)挖掘,發(fā)現(xiàn)EriG的同源蛋白廣泛分布在海洋細(xì)菌、鏈霉菌、粘細(xì)菌、藻類和真菌等多個類群中,進(jìn)一步的生物信息學(xué)分析表明EriG及其同源蛋白屬于UbiA異戊烯基轉(zhuǎn)移酶超家族中的全新成員,代表了一類全新的二萜環(huán)化酶;利用合成生物學(xué)方法從擔(dān)子菌和細(xì)菌中鑒定了該家族7個二萜環(huán)化酶的功能并發(fā)現(xiàn)了一個新骨架二萜化合物。
  學(xué)習(xí)組的工作解決了長期以來困擾人們的鳥巢烷二萜環(huán)化酶的鑒定難題,拓展了人們對于UbiA異戊烯基轉(zhuǎn)移酶超家族蛋白生化功能的認(rèn)識和理解,豐富了二萜環(huán)化酶的類型,同時為鳥巢烷二萜的生物制備奠定了重要理論基礎(chǔ)。
  以上學(xué)習(xí)成果以Discovery and Characterization of a New Family of Diterpene Cyclases in Bacteria and Fungi 為題在線發(fā)表在德國應(yīng)用化學(xué) 雜志(Angew. Chem. Int. Ed. 2017,DOI: 10.1002/anie.201700565)。微生物所助理學(xué)習(xí)員楊彥龍是該論文的第一作者。該學(xué)習(xí)工作得到了陶勇、溫廷益和尹文兵學(xué)習(xí)組的支持和幫助。該工作得到國家自然科學(xué)基金(81673334;21472233;)、“973”項目(2014CB138304)和中科院戰(zhàn)略生物資源服務(wù)網(wǎng)絡(luò)計劃(ZSTH-016)的資助。

  圖注:UbiA家族二萜環(huán)化酶及其環(huán)化產(chǎn)物微生物所等在藥用真菌二萜環(huán)化酶研究中取得進(jìn)展  |  責(zé)任編輯:蟲子
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