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科學(xué)家發(fā)現(xiàn)精子中一個來源于28S rRNA的新小RNA

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科學(xué)家發(fā)現(xiàn)精子中一個來源于28S rRNA的新小RNA

摘要: 　　5月10日，國際學(xué)術(shù)期刊分子細胞生物學(xué)雜志（J Mol Cell Biol）在線發(fā)表了中國科學(xué)院生物化學(xué)與細胞生物學(xué)學(xué)習(xí)所張永蓮學(xué)習(xí)組的最新學(xué)習(xí)成果：A sequence of 28S rRNA-derived small RNAs is enriched in mature ...

　　5月10日，國際學(xué)術(shù)期刊分子細胞生物學(xué)雜志（J Mol Cell Biol）在線發(fā)表了中國科學(xué)院生物化學(xué)與細胞生物學(xué)學(xué)習(xí)所張永蓮學(xué)習(xí)組的最新學(xué)習(xí)成果：A sequence of 28S rRNA-derived small RNAs is enriched in mature sperm and various somatic tissues and possibly associates with inflammation。
　　近年來，除了miRNAs和piRNAs，其他種類的小非編碼（sncRNAs）被不斷發(fā)現(xiàn)，例如來源于tRNA的tsRNAs。rRNA作為細胞中另一種重要housekeeping RNA，是否也能產(chǎn)生類似tsRNAs的小RNA？目前仍不足深入學(xué)習(xí)。在學(xué)習(xí)員張永蓮和副學(xué)習(xí)員周玉傳的指導(dǎo)下，助理學(xué)習(xí)員儲辰、余璐等人對小鼠精子中的小非編碼RNA進行深入學(xué)習(xí)，發(fā)現(xiàn)一個來源于28S rRNA，序列特點上與已知tsRNAs十分相似的sncRNA（rsRNA-28S）。進一步學(xué)習(xí)發(fā)現(xiàn)，小鼠現(xiàn)有基因組數(shù)據(jù)中并不包含rsRNA-28S所對應(yīng)的DNA序列信息，在前人利用RNA-seq對小鼠精子小RNA的學(xué)習(xí)中，常規(guī)的genome mapping方式對測序數(shù)據(jù)進行處理時將rsRNA-28S誤認為無法mapping的垃圾序列而丟棄。通過定量實驗，學(xué)習(xí)人員發(fā)現(xiàn)rsRNA-28S在小鼠精子中的豐度甚至高于已知的tsRNAs，同時其還在多個體細胞中存在表達。體細胞的rsRNA-28S能響應(yīng)LPS刺激發(fā)生表達改變，而對數(shù)十例人精子樣品的篩查發(fā)現(xiàn)，生殖道炎癥病人白細胞增多癥精子中的rsRNA-28S發(fā)生了顯著變化。這項學(xué)習(xí)發(fā)現(xiàn)了一個和已知tsRNAs十分類似的rsRNA，揭示了現(xiàn)有g(shù)enome mapping方法在小RNA測序分析中的缺乏，并探索了rsRNA-28S的功能。這些結(jié)果提示細胞中可能存在一類“housekeeping RNA-derived”小RNAs，而并非僅僅是來自tRNA的tsRNA。
　　該學(xué)習(xí)工作得到了學(xué)習(xí)員陳德桂、劉默芳、王紅艷，上海市計劃生育學(xué)習(xí)所學(xué)習(xí)員施惠娟以及法國Clermont Université教授Joël R. Drevet的大力協(xié)助，并得到了國家自然科學(xué)基金委、科技部的學(xué)習(xí)經(jīng)費資助及生化與細胞所分子生物學(xué)技術(shù)平臺的支持。



　　圖：白細胞增多癥病人與正常人精子中的rsRNA-28S有顯著差異。相比正常精子，白細胞增多癥病人精子rsRNA-28S的Upper band顯著缺失，這或能作為一種新的臨床精子檢測Marker。科學(xué)家發(fā)現(xiàn)精子中一個來源于28S rRNA的新小RNA  |  責(zé)任編輯：蟲子
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